A floresta semidecídua ocupa a maior parte da Serra do Japi, até as altitudes em torno de 1000 m. É uma vegetação alta, com dossel entre 15 e 20 m de altura e indivíduos emergentes de 20 a 25 m. Nessa floresta, que possui uma alta diversidade de espécies arbóreas, as árvores possuem troncos grossos e o dossel não forma uma camada contínua.

Nas florestas semidecíduas da Serra do Japi, as famílias mais bem representadas tanto em número de espécies quanto em número de indivíduos (número de árvores de cada espécie) são Caesalpiniaceae, Fabaceae, Mimosaceae, Rutaceae, Meliaceae, Euphorbiaceae, Myrtaceae, Rubiaceae e Lauraceae (ver Tabela I). Há ainda famílias com poucas espécies, mas muitos indivíduos, como Anacardiaceae, Lecythidaceae e Myrsinaceae.

Nas manchas em diferentes estádios de sucessão secundária, são encontradas árvores com características de pioneirismo, como Trema micrantha, Cecropia pachystachya, Acacia polyphylla, Piptadenia gonoacantha, Tibouchina sellowiana, Piper amalago, Sessea brasiliensis, Solanum inaequale, Solanum swartzianum, Celtis iguanae, Aegiphila sellowiana.